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深度解析:二代基因測序帶來的腫瘤精準醫療時代新契機

發布時間:2016-05-06 信息來源:


導讀

醫學研究已經迎來了精準醫療的新時代,剛剛還在實驗室中應用的工具,轉眼之間已經被應用于臨床研究。隨著第二代測序技術及生物學進展,腫瘤治療領域也正在經歷迅猛的發展。



什么是精準醫療?

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精準醫療(Precision Medicine)是近幾年興起的疾病治療方案,它強調在治療時考慮個人的基因變化,環境影響,生活方式等。基于患者的遺傳信息的診斷測試結合其他分子或細胞的分析結果,再針對性地選擇適當和最佳療法。支持技術包括分子診斷,成像和分析軟件。


主要的技術進步通常會帶來超越技術初始目標的創新和改變。第二代測序(NGS)技術、各種組學的應用、不斷增長的計算能力和日益累積的“大數據”,將促進精準醫學在腫瘤學中的發展。



癌癥的精準治療理念

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癌癥的本質是多基因的遺傳疾病,隨著腫瘤發展,癌癥細胞仍然在不斷地進行分裂和增殖積累突變,有高度的異質性,其基因組具有不穩定性。近年來我們意識到癌癥的分類按照簡單的組織部位是不夠的,藥物的單一治療效果也不理想(有效率僅有20%)。比起傳統的病理報告,基因組測序信息能提供更加精準有效的分型診斷。


二代測序,又名下一代測序(Next Generation Sequencing,NGS),也叫高通量測序(High-Throughput Sequencing),是相對于傳統的桑格兒測序(Sanger Sequencing)而言的。顧名思義,二代測序最大的優勢就在于:“高通量”:一次對幾十萬到幾百萬條核酸分子進行序列測定。換言之,可以實現低成本下的多基因、多位點、多樣本的檢測。帶著這個優勢,二代測序在腫瘤臨床中主要進入了以下兩大領域:



1個體化用藥指導


靶向治療現如今已經成為腫瘤治療的首要手段,也是二代測序在腫瘤臨床中的主要應用領域。目前,針對主要癌種的主要靶向相關基因檢測,很多醫院病理科均已常規開展。但隨著研究的進展,靶向藥物越來越多,與某一靶向藥物相關的基因也越來越多,因此常規的檢測項目就有了局限,使用高通量測序進行多基因檢測,尋找更多靶向治療的機會已經成了很多患者的需求。最新的非小細胞肺癌NCCN指南中也已經推薦多基因檢測。



2腫瘤風險評估


目前,有超過200種的遺傳性癌癥已經被報道,遺傳性癌癥多是由患者攜帶某種基因異常引起的。因此,提前預防,早期發現,早期治療則是這類人群最好的選擇。



除腫瘤領域之外,二代測序還可以應用于遺傳病檢測、疑難雜癥研究、婦嬰生育保健、病源微生物等多個領域。


相關統計數據顯示:目前約有2500多種疾病已經有了對應的基因檢測方法,并在美國臨床合法應用,甚至基因檢測已成為美國疾病預防的常規手段之一。


從二代測序風風火火進入臨床視野,隨后雖然經歷了試點單位成立、取消、規范化等各種曲折,但其未來的應用、發展已經逐漸明了,成為必然,相信此技術定能為廣大病理、臨床工作者帶來更多的幫助!



精準治療海內外動向

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美國:

2015年1月奧巴馬宣布了精準醫療計劃(PMI,Precision Medicine Intiative),2016年度財政預算中將有$2.16億的科研經費用于積極推進精準醫療,并為精準醫療確定了短期和長期的目標。短期目標包括在癌癥研究領域不斷擴大應用。NIH(美國國立癌癥研究所)希望基于疾病的基因和生物學知識,來尋找新的更有效的癌癥治療方法。長期目標則集中在大規模引進精密醫藥衛生和醫療保健的各個領域。美國國立衛生研究院計劃收集包括美國各地的1萬多名志愿者的基因數據、生物樣品和其他健康信息。分析大范圍數據來更好的預測疾病風險,了解疾病是如何發生的,并改進診斷和治療策略。


英國:

政府創新中心將推出一個“精密醫學彈射器”計劃,-旨在加快精密醫學的發展,2015年10月26日宣布將建立六個中心,每個中心將作為英國的整體網絡內的區域精密醫學活動樞紐,在劍橋總部進行統籌,以更精確地了解疾病,以及有更可預測的、更安全、成本效益高的治療方法。


中國:

2015年3月,科技部召開了國家首次精準醫學戰略專家會議,計劃在2030年前,中國精準醫療將投入600億元,其中中央財政支付200億元,企業和地方財政配套400億元。最近精準醫療計劃已經完成了論證,“十三五”期間將啟動“精準醫療重點科技研發計劃”,并將選擇性地在全國各個具備條件和優勢的區域中的醫院和社區內建設示范中心。


展 望

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隨著人類對癌癥認識的不斷加深,精準醫療的必要性與迫切性已經得到了醫療界和各國政府的廣泛重視。未來:表遺傳學方向將繼續揭示甲基化是如何調節基因表達,加深我們對癌癥的理解。新組學(蛋白質組和代謝組等)可以揭示癌癥生物學的其他層面,對進一步理解癌癥生物學和藥物開發有重要作用。臨床試驗數據整合和標準化將為精準治療的下一步發展奠定基礎。未來的方向將是生物學,病理學,計算機等多學科的協作,開發新的分子診斷測試,進一步收集患者測序數據并使其方便共享和搜索,發展基礎研究到臨床數據的整合網絡,建立新的數據統計和風險預測模型等。隨著各項配套技術的日趨成熟與完善,精準治療將在癌癥治療中發揮越來越重要的作用。我們有理由對未來充滿希望。



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